La médecine militaire est une médecine exercée sous subordination administrative, concernant autant l'individu que sa collectivité, dans un intérêt réciproque. Cette prise en charge, préventive et thérapeutique, doit pouvoir s'adapter à toutes les conditions rencontrées par l'unité militaire, notamment les situations d'exception (dont les conflits armés ne sont qu'une des expressions).
La médecine militaire est une spécialité médicale bien individualisée, par la spécificité des pathologies, par la spécificité des situations d'exercice, par cette dualité de finalité médicale (l'individu et le groupe).
Une déontologie spécifique s'est donc affirmée, élaborée depuis des siècles. En fait, cette pratique professionnelle, génératrice d'un droit coutumier, n'est pas spécifique de la chose militaire mais des conditions d'exercice, induites par l'exception.
Les caractéristiques médicales rencontrées lors des catastrophes non conflictuelles (catastrophes naturelles, industrielles, humanitaires...), avec la situation de conflit armé sont relativement communes. Donc, tout médecin, exerçant dans ces conditions, doit respecter cette éthique spécifique, développée par la médecine militaire.
Ce travail envisage cette déontologie, à travers les contraintes imposées au médecin militaire, d'ordres thérapeutiques ou non.